1.关于起诉书指控石某向A区公安分局副局长张某行贿40余万元，现有证据能够表明是在石某主动交代后，才对张某进行立案侦查。张某交代的时间比石某晚。由此可见，石某系在未掌握犯罪事实前主动交代。
2.关于起诉书指控石某向A区公安分局XX支队队长赵某行贿19万元的，从现有证据看，石某在侦查机关为掌握向赵某的行贿事实前，主动交代。
3.关于起诉书指控石某向重庆市公安局XX管理总队X支队队长肖某行贿12余万元，从现有证据看，系石某先供述侦查机关未掌握的行贿事实。
4.起诉书指控，石某向重庆市B区分局XX支队副支队长兰某行贿10余万元。侦查机关并没有将证据提供完全，石某在之前已经交代了向兰某行贿的事实，而侦查机关没有提供，现有证据不能证明，是石某先供述还是其他人先供述，现有证书存疑，不能排除系石某先供述的合理怀疑，希望法院根据有利于被告原则，认定石某先供述。
综上所述，起诉书指控的石某涉嫌行贿的事实中，向张某、赵某、肖某行贿的事实均是石某先供述后，再对受贿人进行的立调查。关于向兰某行贿的事实，虽然未查清是否为石某先供述。但现有证据能够显示，赖某供述的仅有4、5万，与指控金额差距较大，不属于如实供述主要犯罪事实。石某已经属于是如实供述了主要犯罪事实。石某向兰某行贿的金额相对较少，即便未能查清是石某先说还是其他人先供述，也并不影响石某构成余罪自首的情节认定。
（二）、辩护人认为，石某属于是单位行贿
从现有证据可知，石某向张某等人行贿的所有款项，均是自己先行垫付后，以招待费的名义，从单位进行报销。石某购买重庆某娱乐经营管理有限公司时，并非为了实施犯罪活动，而是事实正规的推拿按摩。石某办理的洗浴中心等，大部分是以重庆某娱乐经营管理有限公司的名义签订合同，所以，本案应该属于单位行贿罪。
以上意见，望法院依法采纳！